Przywileje przysługujące upoważnionym przedsiębiorcom AEO to m.in.:
- mniejsza liczba kontroli dokumentów i kontroli fizycznych,
- priorytetowe traktowanie przesyłki w przypadku wytypowania do kontroli - przeprowadzenie kontroli poza kolejnością,
- wybór miejsca przeprowadzenia kontroli,
- uprzednie powiadomienie o wybraniu przesyłki do kontroli,
- szybszy i łatwiejszy dostęp do uproszczeń celnych,
- uznawanie statusu AEO,
- ułatwienia w procesie ubiegania się o status zarejestrowanego agenta, znanego nadawcy i uznanego nadawcy,
- priorytetowa obsługa zgłoszeń celnych,
- priorytetowa obsługa wszelkich wniosków składanych w sprawach celnych do organów KAS,
- specjalne miejsca obsługi dla AEO,
- odrębne pasy ruchu,
- newsletter wysyłany do AEO,
- przyznawanie większych ułatwień fakultatywnych w pozwoleniach na stosowanie procedury uproszczonej,
- uruchomienie dla posiadaczy AEO linki kontaktowej z koordynatorem ds. AEO i Uproszczeń,
- mniej załączników do wniosków
- udział w spotkaniach z zakresu tzw. "profilaktyki merytorycznej"
- zakończenie procedury tranzytu w systemie NCTS i objęcie towarów w ramach wpisu do rejestru zgłaszającego, np. procedurą dopuszczenia do obrotu,
- zamknięcia urzędowe,
- rozliczenie podatku VAT w deklaracji podatkowej.