W celu przeprowadzenia pogłębionej analizy jakości procesów i procedur oraz weryfikacji poprawności realizowania obowiązków podatkowych zespół audytowy zwróci się do podatnika o: 

• przedłożenie procedur istotnych z punktu widzenia specyfiki organizacji,
• badanie na wybranej próbie (np. przedłożenie określonych dokumentów potwierdzających stosowanie danej procedury/ przebieg danego procesu), 
• udzielenie odpowiedzi na zadane pytania.

Prosząc o przekazanie dokumentów/informacji zespół audytowy będzie na bieżąco informował podatnika z jakiego powodu są one potrzebne.

W toku audytu podatnik jest na bieżąco informowany o stwierdzonych nieprawidłowościach w realizacji obowiązków podatkowych oraz zapoznawana z ewentualnymi uwagami co do skuteczności i adekwatności RWNP.