Koszty uzyskania przychodu w usłudze Twój e-PIT

System przygotowujący deklaracje podatkowe uwzględnia w kosztach uzyskania przychodów ze stosunku pracy wartości wskazane w PIT-11. Nie koryguje ich jednak, w przypadku gdy PIT-11 (wystawiony zgodnie z objaśnieniami do formularza), nie pozwala na prawidłowe wypełnienie formularza PIT-37. Problem występuje przy tzw. uldze dla młodych. Jeśli podatnik poniżej 26 roku życia uzyskał przychód ze stosunku pracy ponad zwolnione 85 528 zł (art. 21 ust. 1 pkt 148 u.p.d.o.f.), to ma prawo do kosztów uzyskania przychodów wynikających z art. 22 ust. 2 ustawy o PDOF (standardowo 3000 zł), ale do wartości nie wyższej niż nadwyżka przychodu ponad 85 528 zł (art. 22 ust. 3b u.p.d.o.f.). Jeśli pracodawca przez część roku uwzględniał w kalkulacji zaliczek na podatek wskazaną wyżej ulgę, to nie stosował kosztów z art. 22 ust. 2 u.p.d.o.f. Pracodawca, zgodnie z przypisem nr 14 do formularza PIT-11, powinien wykazać tylko faktycznie uwzględnione przez niego koszty (czyli z okresu po "wyczerpaniu" ulgi). Problem polega na tym, że system nie uwzględnia w takim przypadku automatycznie prawa podatnika do rozpoznania kosztów w pełnej wysokości zgodnie z art. 22 ust. 2 w związku z ust. 3b u.p.d.o.f., wskazując w to miejsce wartość wskazaną przez pracodawcę w PIT-11.