Czy dla rozróżnienia plików JPK MAG zastosowanie mają magazyny księgowe czy fizyczne w przedsiębiorstwie? Przykładowo firma posiada jeden fizyczny magazyn w ramach którego funkcjonuje: Magazyn surowców, Magazyn handlowy, Magazyn półproduktów. Są to magazyny księgowe. Czy dla każdego z tych magazynów powinien powstać odrębny plik JPK_MAG?
Struktura JPK_MAG służy do raportowania dowodów magazynowych - PZ, WZ, RW i MM, które dokumentują operacje gospodarcze mające miejsce w obrocie magazynowym (zwiększenia, zmniejszenia, przesunięcia międzymagazynowe) niezależnie od typu wyodrębnionego magazynu (np. magazynu materiałów, magazynu towarów, magazynu wyrobów gotowych). Dla każdego wyodrębnionego magazynu powinien powstać odrębny plik JPK_MAG. Dowody Pz (zwiększenia stanu magazynowego) i Wz (zmniejszenia stanu magazynowego) są powiązane odpowiednio z fakturami zakupu i sprzedaży. Dowód Rw – rozchód wewnętrzny, zmniejszenie stanu magazynowego związany ze zużyciem na potrzeby jednostki. Dowód MM dokumentuje zwiększenia i zmniejszenia stanu magazynowego związane z przesunięciami między magazynami jednostki.